Geneious
自動標注,實時序列分析和蛋白質結構預測
用我們全面的DNA序列編輯工具對您的序列充滿信心。 編輯并注釋序列,然后將您的作品導出為可發布的圖像。
使用自動注釋很容易發現
根據公共或本地數據庫中的現有模式和注釋自動注釋新基因組,包括將ORF注釋為基于這些模式和基于NCBI的查詢的假設基因。
- 用ORF標注序列或用Glimmer預測基因
- 通過復制和粘貼序列搜索圖案
- 基于相似性的注釋(大型序列數據庫)
- 使用對齊方式傳輸注釋
- 用火衛一檢測串聯重復
強大的SNP檢測和變異調用
在美麗的瀏覽器中導航讀取。 在序列查看器中手動輕松識別,檢查和解決分歧,或快速注釋較大重疊群上的變異。 該功能可以配置為
- 通過查找高于最低閾值的分歧來屏幕讀取錯誤。
- 僅在編碼區域找到分歧
- 確定變異對蛋白質翻譯的影響,包括僅密碼子中第一個和第三個位置發生變化的變異
- 計算SNP正確的概率
- 消除高鏈偏倚的SNP
- 將您的變體導出到csv
- 搜索并注釋短的結構變體,例如短串聯重復序列(STR)和插入和刪除事件(InDels)
實時序列預測
只需點擊幾下,您就可以找到您的序列,包括:
- DNA翻譯 - 翻譯和補充您的核苷酸序列。 一次翻譯任何一幀或全部6幀,或者只是翻譯您感興趣的注釋或選擇。
- 共有序列 -根據您選擇的身份方案,其中包括在其上會自動選擇最佳的基地呼叫色譜數據“以質量求共識”預測一致序列
- DNA序列 - 預測身份,讀取覆蓋率,有關基本頻率,殘基頻率,CpG島等的眾多統計數據
- 蛋白質序列 - 預測分子量,等電點,疏水性,跨膜區域,卷曲螺旋區域,氨基酸電荷等