Geneious Biologics注釋算法擊敗IgBLAST,MiXCR
Geneious針對專業(yè)治療性抗體發(fā)現(xiàn)的強大生物信息學支持白皮書下載
周四,2018年5月3日,上午9:44
新聞稿:Geneious Biologics
MiXCR表示,Geneious Biologics注釋算法擊敗IgBLAST。
新西蘭奧克蘭 - 2018年5月2日 - 今天發(fā)布的白皮書顯示,針對抗體篩選和發(fā)現(xiàn)的商業(yè)軟件解決方案Geneious Biologics開發(fā)的注釋算法優(yōu)于開源序列分析軟件IgBLAST和MiXCR。
白皮書概述了為什么準確的抗體序列注釋對于進行治療性抗體研究的公司很重要。生物藥物開發(fā)涉及越來越多的抗體序列數(shù)據(jù)。這引入了圍繞準確篩選大量候選序列的核心問題,短時間尺度內(nèi)以確定最有希望的、有用的。?
在一系列比較測試中,MiXCR 2.1.9,IgBLAST和Geneious Biologics注釋算法的任務是分析相同的數(shù)據(jù)集 - 美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)參考數(shù)據(jù)庫SRR5754964(Human)。
由于缺乏行業(yè)黃金標準數(shù)據(jù)集,因此評估序列注釋的準確性是困難的,然而,與IgBLAST和MiXCR相比,Geneious Biologics在注釋CDR區(qū)和生殖系基因方面的表現(xiàn)與三種算法的一致結(jié)果最相關(guān)。在Geneious Biologics不同意共識結(jié)果的極少數(shù)情況下,生物信息學家密切審查結(jié)果,并確定Geneious Biologics總體上是正確的,而MiXCR和I??gBLAST都不正確,表明Geneious Biologics相對于這些流行的開源工具具有優(yōu)越的性能。
白皮書作者兼Geneious Biologics Solutions副總裁Jannick Bendtsen博士說:“速度和準確性對于進行高度特異性研究以確定和驗證潛在治療性抗體候選物的組織絕對重要。
“很少有現(xiàn)有的軟件提供商提供滿足專業(yè)治療性抗體研究人員速度和精度要求的解決方案。因此,我們大力投資開發(fā)以確保Geneious Biologics提供一流的技術(shù)來加速治療性抗體的發(fā)現(xiàn),“Bendtsen博士說。
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